约翰‧克拉克，这位前海豹部队队员、密勤局乾员，一向都是雷恩故事中的重要角色。他拥有许多与杰克‧雷恩相同的动人特质，但也同时拥有九十年代后期人类所惯有的偏执；他篤信暴力可以解决一切，认为武力是吓阻恐怖主义的最佳手段。

在《虹彩六号》当中，约翰‧克拉克已成为故事的主人翁；他有鉴于在冷战结束后仍有许多恐怖份子继续在世界各地活动，因此向雷恩总统提议成立一支反恐怖活动的部队，以期扫除世界上所有的恐怖主义。这个提议很快就获得总统的同意，并任命克拉克为这支部队的总指挥。

于是，一支由美国中情局人员，结合英、法、德四国菁英所组成的特种部队便从而诞生，并取名为「虹彩」，而克拉克就是最高指挥官「虹彩六号」。就在这支精锐部队刚刚成立之际，世界上恰巧发生了接二连三的恐怖事件，正好给了「虹彩」部队展露头角的机会。

这一连串的事件虽然看似各自独立，但发生时机的凑巧却引起克拉克的重视，尤其是当俄国当局开始针对虹彩部队进行调查之后，更令克拉克怀疑这些恐怖行动是否与俄国有关？ 然而，就在虹彩部队与恐怖份子对峙之际，更大的危机却正一步步逼进，而且一旦爆发，将把人类推向灭亡之路…… 汤姆‧克兰西藉由虹彩部队、前苏联国安会乾探、悉尼奥运，以及一群对环境保护环有激进思想的美国科学家的叙述，进而巧妙地揭露整个故事的中心主题──湿婆病毒的秘密。全书充满许多在混密通信、传送和解密方面的最新科技发明，其逼真之程度，令各国政府都大感震惊，而且都不敢承认他写的是确有其事。